Paul-Emmanuel was een telg van de bekende bankiersfamilie Janssen en was ook zijn hele leven bankier bij de Generale Bank. In 1988 werd hij CEO van de Generale Bank en in 1992 voorzitter. Nadat de Generale Bank in 1998 werd overgenomen door Fortis, stapte hij op.
Tijdens zijn loopbaan was hij ook onder meer voorzitter van de Belgische Vereniging van Banken, bestuurder en lid van het directiecomité van het Verbond van Belgische Ondernemingen (VBO) en zetelde hij in de raden van bestuur van onder meer Solvay, Atlas Copco Zweden, de Antwerp Diamant Bank en de groep Lhoist.