Tijdens die overstromingen had ook heel wat spoorinfrastructuur schade opgelopen. Daarom had de federale regering beslist Infrabel en NMBS een prefinanciering toe te kennen om de schade te herstellen. Op basis van voorlopige ramingen werd dat bedrag vastgelegd op 63,17 miljoen euro voor Infrabel en 4,94 miljoen euro voor NMBS.
Intussen werd de balans opgemaakt van de effectief gemaakte kosten en kwamen er vergoedingen van de verzekeringsmaatschappijen en het Europees Solidariteitsfonds. Op basis daarvan werd beslist dat Infrabel en NMBS respectievelijk 20,57 miljoen euro en 810.942 euro moeten terugbetalen.